Отвлечение России борьбой с польско-шведской интервенцией в 1606 году было на руку Аббасу I и дало ему возможность особо не скрывать своих намерений в отношении Дербента, в котором численность его войск, а также шахских чиновников и колонистов непрерывно возрастала. Стремясь превратить Дербент в стратегическую базу в борьбе за господство над Дагестаном, а позднее и над Северным Кавказом, шахские военачальники развернули работы по укреплению Дербента, возведя две поперечные стены, разделили город на три части, каждая из которых имела свою оборонительную систему.
В то же время это позволяло шахским военачальникам «держать город в повиновении». Удлинены были стены в сторону моря, а на берегу была выстроена башня. Вскоре в Дербент переселили 400 семей баятского племени, которые должны были стать опорой шаха.
К середине XVII века число иранских колонистов в Дербенте достигло девяти тысяч человек. Шах стал заселять фарсиязычным населением не только Дербент, но и прилегающие к Дербенту селения.
Были проведены в Дербенте и административные реформы, которые привели к насаждению в городе персидских порядков. Это постепенно стало встречать оппозицию местного населения, вызывать его недовольство, которое возрастало по мере ожесточения отношения шахских чиновников и военачальников к местному населению по мере упрочения их позиций в Дербенте. Видя растущее недовольство дербентцев нетерпимым обращением с ними, шахские чиновники под предлогом борьбы с суннизмом изгоняли местных жителей из города. Поскольку шах Аббас I был веротерпим и к религиозным вопросам относился равнодушно, можно полагать, что вопрос религиозных разногласий искусственно раздули, чтобы изгнать местных жителей из города и обеспечить господство иранцев.
Конфликт иранских колонизаторов с дагестанцами назревал. Поводом к первому вооруженному столкновению в 1607-1608 годах послужила попытка шахского военачальника (зятя Аббаса I) Зульфугар-хана, назначенного правителем Ширвана, выбить табасаранцев с небольшой территории в Шабране, занятой ими еще при господстве турок, построить на этом месте крепость, разместить в ней иранский гарнизон и взять под контроль торговую трассу Дербент-Шабран-Шемахи.
Зульфугар-хан прибыл к спорному месту с войском, предложил табасаранскому правителю Майсум-хану покинуть эту местность. Майсум-хан решительно отказался сделать это. Зульфугар-хан пытался его уговорить. Все было напрасно. Более того, когда Зульфугар-хан вопреки сопротивлению Майсум-хана разбил план крепости и приступил к ее строительству. Табасаранский правитель, явившись с войском, потребовал прекратить строительные работы. Переговоры ни к чему не привели. Произошло сражение, в котором погибла тысяча табасаранцев. Сведений о потерях иранцев не сохранилось, но и у них были потери.
Резонанс этого конфликта был очень сильным. Особенно тяжело его переживали табасаранцы, хотя он удручающе отразился на душах и других дагестанцев. Шах Аббас I дал приказ Зульфугар-хану, во что бы то ни стало примириться с противником. Однако непомерная гордость Зульфугар-хана была причиной углубления противоречий и нового конфликта.
В 1610-1611 годах произошло новое вооруженное столкновение в стороне Астал между Зульфугар-ханом и Табасараном. В результате «погибло множество голов мусульман и голов рафизитов», т.е. кизылбашей. Жестокая расправа иранских войск с табасаранцами обострила политическую ситуацию в Дагестане, она положила конец иллюзиям дагестанцев о миролюбивости шаха Аббаса I